Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM35Q9UPQ4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM35Q9UPQ4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms