Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYNPO2Q9UMS6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2Q9UMS6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms