Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms