Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLIP2Q9UDT6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms