Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPASTQ9UBP0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPASTQ9UBP0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms