Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMOD2Q9NZR1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMOD2Q9NZR1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms