Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EHD3Q9NZN3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms