Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms