Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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