Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNNM1Q9NRU3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms