Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TULP4Q9NRJ4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms