Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INCENPQ9NQS7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INCENPQ9NQS7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms