Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RTN4Q9NQC3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms