Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB9BQ9NP90 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms