Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARFGAP3Q9NP61 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms