Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF2Q9HAU5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms