Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C2

ARV1, Protein ARV1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARV1Q9H2C2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARV1Q9H2C2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms