Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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C20orf27Q9GZN8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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C20orf27Q9GZN8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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C20orf27Q9GZN8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C20orf27Q9GZN8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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C20orf27Q9GZN8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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C20orf27Q9GZN8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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C20orf27Q9GZN8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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C20orf27Q9GZN8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C20orf27Q9GZN8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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