Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms