Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP3Q9BWW4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms