Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC94Q9BW85 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms