Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTA3Q9BTC8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms