Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms