Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNS3Q9BQ31 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNS3Q9BQ31 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms