Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms