Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms