Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSF3RQ99062 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms