Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CITED4Q96RK1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms