Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms