Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC38A2Q96QD8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms