Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms