Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q96MF0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q96MF0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q96MF0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q96MF0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms