Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms