Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRIG1Q96JA1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms