Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CELF6Q96J87 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms