Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC11Q96J66 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms