Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPNQ96H22 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms