Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC35A4Q96G79 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC35A4Q96G79 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms