Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDAC11Q96DB2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDAC11Q96DB2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms