Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFT1Q96AA3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms