Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNPO1Q92973 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms