Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOMQ8WWX9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms