Protein–RNA interactions for Protein: Q8TER0

SNED1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNED1Q8TER0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNED1Q8TER0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNED1Q8TER0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms