Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AVL9Q8NBF6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms