Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNBD1Q8NA66 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNBD1Q8NA66 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms