Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00612Q8N6U2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms