Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC83Q8IWF9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms