Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF3Q7Z739 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF3Q7Z739 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms