Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE3BQ7Z3V4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE3BQ7Z3V4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms