Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX7Q7RTT5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX7Q7RTT5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SSX7Q7RTT5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSX7Q7RTT5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SSX7Q7RTT5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SSX7Q7RTT5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SSX7Q7RTT5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SSX7Q7RTT5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSX7Q7RTT5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSX7Q7RTT5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSX7Q7RTT5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SSX7Q7RTT5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSX7Q7RTT5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSX7Q7RTT5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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